Respuesta de nuestro experto:

La carpeta como su propio nombre indica es un almacen de ficheros temporales, y no solo no pasa nada por borrarlos sino que es recomendable hacerlo de vez en cuando.

La forma mas efectiva en iniciando el windows en modo a prueba de fallos, yendo a inicio - ejecutar, escribiendo %temp%, se seleccionan todos los archivos con CTRL+E y se borran, deberia dejarte borrarlos todos.